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Les plateformes d’intégration de données massives issues du soin, des bases de données médico-administratives et de la recherche contribuent à optimiser et d'accélérer la production de nouvelles connaissances. Ces entrepôts de données supportent par exemple la recherche de nouvelles indications pour des médicaments connus, la pharmacogénétique, les analyses PheWAS, la compréhension des mécanismes impliqués dans les phénotypes rares, l’identification de sous populations, l’analyse de phénomènes incidents, les essais cliniques. La requalification des données de soins pour la recherche génère de nouvelles connaissances et permet la création d'algorithmes qui sont utiles pour les décisions prises ensuite pour les patients. Ce cercle vertueux, appelé en anglais Learning Health System, est un enjeu majeur pour l'informatique biomédicale.