Notre travail a montré qu’un système de surveillance épidémiologique (SEpi), comme ceux basés sur la téléphonie mobile, doit être obligatoirement intégré au système national. Souvent les acteurs extérieurs imposent et décident de la mise en place d’un système d'information (SI), sans réelle concertation avec les utilisateurs et responsables, sans intégration au système national, sans réflexion à long terme, sur le fonctionnement, les coûts, les développements. Les utilisateurs et les responsables doivent s’approprier le dispositif, tant dans sa mise en place que dans le maintien, le développement et l’analyse. L’exemple de la variation spatio-temporelle du paludisme a montré que des facteurs non sanitaires, en l’occurrence environnementaux, impactent sur la survenue d’épidémies.
Il est donc nécessaire, pour avoir une vision de la situation épidémiologique dans un contexte de décision nationale, d’intégrer ces facteurs pour optimiser l’analyse et la SEpi. Il est indispensable, pour une analyse utile d’une situation épidémiologique, d’avoir, en temps réel, des échelles spatiales et temporelles très fines. Le succès du développement d’un SI réside principalement dans l’implication des autorités à chaque niveau hiérarchique. Sans politique de SIS décidée au plus haut niveau, structurée et activement coordonnée, toute mise en œuvre d’un nouvel outil (tablette, téléphone etc.) est vouée à l’échec, quel que soit le budget alloué. Il faut sortir de la tradition de bilan/rapport annuels qui n’analyse que des informations agrégées passées, déconnectées du SI national, pour entrer dans la SEpi 2.0 en temps réel, réactive, intégrée dans un SIS structuré et coordonnée nationalement.
